Formation Réaliser ses analyses biostatistiques avec R

Objectifs

Apprendre à utiliser le logiciel R pour analyser des données du domaine biomédical.
Mettre en oeuvre dans R les méthodes de statistique descriptive, décisionnelle, analyse de la variance, régression linéaire et logistique

Compétences visées

- Mettre en œuvre dans R des analyses statistiques uni et bivariées sur des données quantitatives comme qualitatives
- Générer des données suivant une loi, évaluer la précision d'une méthode par rééchantillonnage
- Établir avec R des intervalles de confiance autour de paramètres comme moyenne, proportion et variance
- Réaliser les principaux tests d'hypothèses paramétriques et non paramétriques dans le logiciel
- Mettre en œuvre des analyses de la variance à un ou deux facteurs pour la comparaison de moyennes de population
- Réaliser une ANOVA sur mesures répétées dans le cas où les données ne sont pas indépendantes
- Élaborer un modèle établissant une relation linéaire entre une variable à expliquer et une (régression simple) ou plusieurs (régression multiple) variables explicatives
- Construire un modèle de régression logistique pour expliquer une variable binaire (la présence ou l'absence d'une caractéristique donnée) à l'aide de variables explicatives

Public

Toute personne souhaitant analyser des données biomédicales avec R

Pré-requis

Pour suivre ce stage dans de bonnes conditions, il est recommandé d'avoir suivi en amont la formation R – Prise en main, analyses statistiques et graphiques ou d'avoir atteint par la pratique un niveau équivalent

Méthode pédagogique

Pédagogie active mêlant exposés, exercices et applications pratiques dans le logiciel R.

Programme

- Statistiques descriptives

Tableaux de données (individuelles, de fréquences, regroupées, croisant plusieurs variables)
Distribution (paramètres de forme, position, dispersion)
Associations (variables quantitatives et/ou qualitatives)
Représentations graphiques (variables quantitatives et/ou qualitatives)

- Lois et Simulations avec R

Lois connues
Générations de données sous R
La méthode du bootstrap

- Intervalles de confiance

Pour une moyenne
Pour une proportion
Pour une variance

- Tests d’hypothèses

Premiers tests statistiques paramétriques

De moyennes (test de Student)
De variances
De proportions (tests d’indépendance, de chi2)
De corrélation

Tests non paramétriques

Tests d’adéquation
Tests de position

P_valeurs (p-value)

- Analyse de variance

Anova simple (à un ou deux facteurs)
Anova pour mesures répétées

- Régression linéaire

Objectifs, contexte et modèles
Corrélation
Régression linéaire simple
Régression linéaire multiple
Tests et interprétations des sorties
Validation des hypothèses

- Régression logistique simple et multiple

Objectifs, contexte et modèles
Ajustements
Tests et interprétations des sorties
Validation des hypothèses (analyse des résidus)

Modalités d'évaluation

Un formulaire d'auto-évaluation proposé en amont de la formation nous permettra d'évaluer votre niveau et de recueillir vos attentes. Ce même formulaire soumis en aval de la formation fournira une appréciation de votre progression.
Des exercices pratiques seront proposés à la fin de chaque séquence pédagogique pour l'évaluation des acquis.
En fin de formation, vous serez amené(e) à renseigner un questionnaire d'évaluation à chaud.
Une attestation de formation vous sera adressée à l'issue de la session.
Trois mois après votre formation, vous recevrez par email un formulaire d'évaluation à froid sur l'utilisation des acquis de la formation.

Solutions de financement

Cette formation peut être financée :

dans le cadre du plan de développement des compétences de votre Entreprise
par l’OPCO (opérateur de compétences) de votre Entreprise ou le FAF (Fonds d’Assurance Formation) pour les professionnels libéraux
par France Travail dans le cadre du dispositif de l'Aide Individuelle à la Formation (soumis à accord de votre Agence)
à titre personnel

Accessibilité

Vous souhaitez suivre notre formation Réaliser ses analyses biostatistiques avec R et êtes en situation de handicap ? Merci de nous contacter afin que nous puissions envisager les adaptations nécessaires et vous garantir de bonnes conditions d'apprentissage